本文将分享如何在AWSlinux操作系统中安装生物信息学库,如trimmomatic、bowtie2、samtools、seqtk等?的详细内容,此外,我们还将为大家带来关于AWSASG的意外行为,A
本文将分享如何在 AWS linux 操作系统中安装生物信息学库,如trimmomatic、bowtie2、samtools、seqtk 等?的详细内容,此外,我们还将为大家带来关于AWS ASG 的意外行为,AWS EKS 中的 AWS 启动模板、AWS CDK - 自定义 aws-lambda-nodejs 和 aws-lambda-python 使用的 Dockerfile、AWS CloudFormation:如何在 AWS Pipeline 中使用 Github Enterprise 作为源、AWS CodeBuild:如何在 AWS 实例中使用 .OVPN 文件的相关知识,希望对你有所帮助。
本文目录一览:- 如何在 AWS linux 操作系统中安装生物信息学库,如trimmomatic、bowtie2、samtools、seqtk 等?
- AWS ASG 的意外行为,AWS EKS 中的 AWS 启动模板
- AWS CDK - 自定义 aws-lambda-nodejs 和 aws-lambda-python 使用的 Dockerfile
- AWS CloudFormation:如何在 AWS Pipeline 中使用 Github Enterprise 作为源
- AWS CodeBuild:如何在 AWS 实例中使用 .OVPN 文件
如何在 AWS linux 操作系统中安装生物信息学库,如trimmomatic、bowtie2、samtools、seqtk 等?
如何解决如何在 AWS linux 操作系统中安装生物信息学库,如trimmomatic、bowtie2、samtools、seqtk 等?
我无法找到一种方法来在基于 AWS linux 的操作系统中安装生物信息学和其他受支持的软件包,而这些软件包可在 ubuntu 中运行,并且他们的文档说它们支持基于 linux 的操作系统。有什么命令可以解决这个问题吗?
解决方法
使用 conda
安装许多常见的生物信息学软件包。例如:使用 conda install seqtk
或 conda create --name seqtk seqtk
安装 seqtk
包。
此 docker
container 拥有您需要的大部分生物信息学软件。您可以获取图像并在正在运行的容器中工作。
如果您不习惯使用 Docker 容器,还可以访问每个软件自己的网站,并根据他们的建议进行下载。
AWS ASG 的意外行为,AWS EKS 中的 AWS 启动模板
如何解决AWS ASG 的意外行为,AWS EKS 中的 AWS 启动模板
我已经创建了 AWS EKS
集群和托管节点组,并且我已经创建了 AWS ASG (Auto Scaling Group)
和 AWS Launch Template
。但是,当我将 AWS Launch Template
附加到托管 EKS 节点组时,它会创建现有(已创建)AWS Launch Template
--
那些启动模板:
DEV/MANAGED/EKS-WORKERS-SM/LATEST/TEMPLATE/EU-CENTRAL-1X
和
eks-XXXXXXXX-XXXXXXXX-XXXXXXXX
完全相同,我不明白 EKS 为什么要创建重复项
--
同样的事情发生在 AWS ASG (Auto Scaling Group)
上,有什么办法可以解决这个问题吗?
使用的技术:
- 地形
- 启动模板资源
- Auto Scaling 组资源
- EKS 资源
- EKS 节点组资源
解决方法
看来,您正在运行这两种资源。当你只想自己管理节点时,你不需要.text-truncate
,而是需要使用EKS node group resource
和Launch Template resource
,并加上适当的标签
AWS CDK - 自定义 aws-lambda-nodejs 和 aws-lambda-python 使用的 Dockerfile
如何解决AWS CDK - 自定义 aws-lambda-nodejs 和 aws-lambda-python 使用的 Dockerfile
是否可以将包 Dockerfile
使用的 aws-lambda-nodejs/aws-lambda-python
更改为包依赖项?
我目前的问题是我们在 CI/CD 服务器上使用 aws-lambda-python
,其中 RUN pip install --upgrade pip
由于服务器上的配置错误而失败。我们对服务器几乎没有控制,所以想单独构建我们自己的镜像来规避这个问题。
AWS CloudFormation:如何在 AWS Pipeline 中使用 Github Enterprise 作为源
如何解决AWS CloudFormation:如何在 AWS Pipeline 中使用 Github Enterprise 作为源
在文档中,我们给出了以下示例:
//def work_version = "2.4.0"
def work_version = "2.5.0-beta02"
// (Java only)
implementation "androidx.work:work-runtime:$work_version"
我已尝试将其更新为使用 GitHub 企业版,但不幸的是它不起作用。 有人可以展示如何正确配置它。 这就是我尝试这样做的方式:
AppPipeline:
Type: AWS::CodePipeline::Pipeline
Properties:
RoleArn:
Ref: CodePipelineserviceRole
Stages:
-
Name: Source
Actions:
-
Name: SourceAction
ActionTypeId:
Category: Source
Owner: AWS
Version: 1
Provider: S3
OutputArtifacts:
-
Name: SourceOutput
Configuration:
S3Bucket:
Ref: SourceS3Bucket
S3ObjectKey:
Ref: SourceS3ObjectKey
Runorder: 1
更新:
我发现 Github Enterprise 使用 codestar-connections。 我已将代码编辑为如下所示:
- Name: Source
Actions:
- Name: Source
Runorder: 1
InputArtifacts: []
ActionTypeId:
Category: Source
Owner: ThirdParty
Provider: GitHubEnterpriseServer
Configuration:
Owner: !Sub ${GitHubRepositoryOwner}
Repo: !Sub ${GitHubRepositoryName}
Branch: !Sub ${GitHubIntegrationBranch}
OAuthToken: !Sub ${GitHubPersonalAccesstoken}
PollForSourceChanges: false # Must be set to false when using webhooks
OutputArtifacts:
- Name: SourceArtifact
我现在处理的问题是连接权限:
Stages:
- Name: Source
Actions:
- InputArtifacts: []
ActionTypeId:
Version: ''1''
Owner: AWS
Category: Source
Provider: CodeStarSourceConnection
OutputArtifacts:
- Name: SourceArtifact
Runorder: 1
Configuration:
ConnectionArn: "arn:aws:codestar-connections:exxxxxxxxf382816da8"
FullRepositoryId: "https://github.xxxxxx/cloudformation"
BranchName: "main"
OutputArtifactFormat: "CODE_ZIP"
Name: ApplicationSource
AWS CodeBuild:如何在 AWS 实例中使用 .OVPN 文件
如何解决AWS CodeBuild:如何在 AWS 实例中使用 .OVPN 文件
我有 .ovpn 文件,我使用它从本地 PC 连接到远程服务器以执行 terraform 命令。 如何使用 AWS CodeBuild Ubuntu 实例中的此文件?
到目前为止,我一直尝试在我的容器中安装 OpenVPN 服务器并使用 .ovpn 建立连接。
- apt install -y network-manager-openvpn-gnome openvpn-systemd-resolved
- openvpn --config test-dev.ovpn
但它无法解析文件中使用的 DNS 名称。 有人可以建议如何解决这个问题吗?
关于如何在 AWS linux 操作系统中安装生物信息学库,如trimmomatic、bowtie2、samtools、seqtk 等?的问题我们已经讲解完毕,感谢您的阅读,如果还想了解更多关于AWS ASG 的意外行为,AWS EKS 中的 AWS 启动模板、AWS CDK - 自定义 aws-lambda-nodejs 和 aws-lambda-python 使用的 Dockerfile、AWS CloudFormation:如何在 AWS Pipeline 中使用 Github Enterprise 作为源、AWS CodeBuild:如何在 AWS 实例中使用 .OVPN 文件等相关内容,可以在本站寻找。
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